El 23 de junio del año 2011 entró en servicio el Centre de Gestió Ferroportuari del Puerto de Barcelona. Este se encarga de gestionar desde un solo punto todos los movimientos ferroviarios que se producen en el Puerto, como son la entrada y salida de los convoyes en el recinto portuario y en las terminales, la coordinación de las operativas con las terminales ferroviarias o la asignación de los slots a cada operador.
El Centro se creó hace 10 años con el objetivo de establecer un marco de relación estable, transparente y fiable con los diferentes implicados en las operativas ferroviarias en el Puerto: las administraciones (ADIF, Ferrocarriles de la Generalidad de Cataluña y la Autoridad Portuaria) y los operadores públicos y privados (operadores logísticos, terminales portuarias, etc.). En consecuencia, entre los primeros logros del Centre de Gestió Ferroportuari destaca el establecimiento de una ventanilla única, a través de la cual se comunican todos estos actores ferroviarios, que ha facilitado la coordinación entre las empresas ferroviarias y las terminales portuarias, mejorando de forma sustancial la agilidad a la hora de cargar o descargar los trenes en el puerto.